捷克無特殊疾病。糖尿病、心血管病及高血壓為常見多發病。捷克醫療體系健全，設施完善，其國民均參加全民醫療保險。外國人在捷克需要購買商業醫療保險，如無醫療保險，到醫院就醫需支付現金。掛號費一般為20歐元左右。捷克急救電話為155，緊急情況下，可撥打SOS電話112求救，該電話可用英語、德語和捷克語服務。捷克藥店的藥物分為處方藥和非處方藥。藥店根據處方給患者免費發放藥物（如這些藥物由保險公司承擔），非保險公司承擔的藥物則需直接付費。

　　2006年3月，在捷克南部赫魯波卡城堡附近首次發現一只死天鵝被證實帶有H5N1禽流感病毒。目前共計發現14宗禽鳥感染H5N1禽流感。目前捷克尚無人感染H5N1病毒而引起死亡的報導，市場上使用的禽流感疫苗主要是Tamiflu,現已儲備600000劑，為以防萬一，捷克衛生部已從瑞士另購600000劑Tamiflu，以上數量可供13%的捷克人口使用。

　　處方的有效期為：

　　來自急救機構的處方24小時有效；

　　抗生素處方5天有效；

　　鴉片處方3天有效

　　其他處方通常一周有效；

　　如處方超出有效期，藥店不提供服務。